目的 了解深圳市出生缺陷发生率、出生缺陷顺位以及流行病学特征,为制定干预措施提供参考依据.方法 按照广东省出生缺陷监测方案,监测2003～2005年孕满28周到产后7d的围生儿.结果 深圳市出生缺陷率从2003年的14.27‰提高到2005年的16.38‰,差异有统计学意义(x2=7.09,P=0.029),平均发生率为15.74‰,3年来出生缺陷前3位分别是先天性心脏病(33/万)、总唇腭裂(19/万)、多指(16/万),≥35岁的产妇、男孩、多胞胎出生缺陷率高发.结论 深圳市围生期出生缺陷监测率近年有升高趋势,深圳市不同区、产妇年龄、胎儿性别、胎数等出生缺陷的发生率不同.