基于TCPA数据库分析宫颈癌蛋白表达及其临床意义

摘要
图/表
参考文献
相关文章 (15)

全文: PDF (1397 KB) HTML (1 KB)
输出: BibTeX | EndNote (RIS)

摘要目的基于癌症蛋白质组图谱(TCPA)以及癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析宫颈癌蛋白表达情况,研究宫颈癌相关蛋白表达对宫颈癌预后及临床意义。方法从TCPA数据库中下载CESC(cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma)患者肿瘤的的反相蛋白芯片(reverse-phase protein arrays,RPPA)数据(v4.2版本,level 4数据,Dataset ID 为TCGA-CESC-L4),以及TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov/,检索时间:2020.06.22)下载CESC患者的临床资料。采用R 3.6.3统计软件,应用KM检验及单因素Cox分析预后相关的蛋白,分析蛋白表达与宫颈癌预后作用,构建风险模型,并进行风险模型的独立预后分析。结果与宫颈癌预后显著相关的纳入风险模型的蛋白有7个,其中CYCLIND1、MEK1_pS217S221、SMAD3、X4EBP1_pT70、YAP、CRAF_pS338为高风险蛋白,Bcl-2为低风险蛋白。基于蛋白表达及预后分析所构建的由7种蛋白组成的宫颈癌预后风险模型是宫颈癌的独立预后因子,AUC为0.804。结论基于对TCPA及TCGA数据库的蛋白表达及预后分析在显示宫颈癌中,蛋白表达与宫颈癌癌的预后显著相关,我们所构建的7种蛋白组成的宫颈癌预后风险模型在评价宫颈癌预后中具有很好的价值,但由于缺乏中国大队列患者组成的数据库数据验证,因此后续仍需要开展大量工作进一步检验其在临床实际应用中的效能。

	服务

	把本文推荐给朋友
	加入我的书架
	加入引用管理器
	E-mail Alert
	RSS
	作者相关文章
	王文湛
	阴克强
	张三元

关键词 ：宫颈癌, 癌症蛋白质组图谱, 蛋白表达, 风险模型

收稿日期: 2020-08-19

ZTFLH:

R71

基金资助:山西省研究生教育创新项目(硕士生组:2020SY260)

通讯作者: 张三元(zsyprofessor@aliyun.com)

引用本文:

王文湛, 阴克强, 张三元. 基于TCPA数据库分析宫颈癌蛋白表达及其临床意义[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(1): 44-48.

链接本文:

http://cjrh.bjmu.edu.cn/CN/ 或 http://cjrh.bjmu.edu.cn/CN/Y2022/V33/I1/44

1 Torre LA,Bray FI,Siegel RL,et al.Global cancer statistics,2012. CA Cancer J Clin,2015,65:87-108.
2 Stolnicus S,Barsan I,Hoang L,et al.International endocervical adenocarcinoma criteria and classification(iecc):a new pathogenetic classification for invasive adenocarcinomas of the endocervix.Am J Surg Pathol,2018,42:214-226.
3 kokawa K,Takekida S,Kamiura S,et al.The incidence,treatment and prognosis of cervical carcinoma in young women:a retrospective analysis of 4975 cases in Japan.Eur J Gynaecol Oncol,2010,31:37-43.
4 陈凯锐,童华生,等.基于数据挖掘分析GALNT2在肺腺癌中的表达及预后意义.解放军医学杂志,2021,07:1-14.
5 Travaglino A,Raffone A,Gencarelli A.et al.TCGA classification of endometrial cancer:the place of carcinosarcoma.Pathol Oncol Res,2020,10:2067-2073.
6 Qiu JJ,Zhang XD,Tang XY,et al.ElncRNA1,a long non-coding RNA that is transcriptionally induced by oestrogen,promotes epithelial ovarian cancer cell proliferation.Int J Oncol,2017 51:507-514.
7 张倩雯,龚云辉,何跃东.HMGN2、CyclinD1在宫颈癌中的表达及临床意义.四川大学学报(医学版),2019,50:580-582.
8 周密,罗祥力,冯露.Beclin1,EGFR,cyclinD1在新辅助化疗宫颈癌组织中的表达及临床意义.标记免疫分析与临床,2020,27:235-240.
9 Sarkisian S,Davar D.MEK inhibitors for the treatment of NRAS mutant melanoma.Drug Des Devel Ther,2018,12:2553-2565.
10 韦荣飞,李梦媛,杨星九,等.Smad3对非小细胞肺癌A549细胞核宫颈癌Hela细胞迁移的影响.中国比较医学杂志,2017,27:11-15.
11 Haiyan Zhu,Hui Luo,Zhaojun Shen,et al.Transforming growth factor-β1 in carcinogenesis,progression,and therapy in cervical cancer.Tumour Biol,2016,37:7075-7083.
12 陈凤霞.宫颈癌病情进展过程中PI3K/AKT/mTOR信号通路的变化及靶基因的探究.海南医学院学报,2018,24:1757-1760.
13 刘兰,杨莎莎,陈海月,等.宫颈癌组织中Ki67与EBP1表达变化及意义.山东医药,2016,56:78-79.
14 王文慧,邵志叶,陈豪.宫颈癌组织中Hippo-Yes相关蛋白1的表达及临床意义.中国现代医学杂志,2020,30:27-32.
15 Lochhead PA,Clark J,Wang LZ,et al.Tumor cells with KRAS or BRAF mutations or ERK5/MAPK7amplification are not addicted to ERK5 activity for cell proliferation.Cell Cycle,2016,15:506-518.
16 Liang M,Zhao J.Protein expression of AIB1,p53 and Bcl-2 in epithelial ovarian cancer and their correlations with the clinical pathological features and prognosis.Eur Rev Med Pharmacol Sci,2018,22:5134-5139.
17 Shukla S,Dass J,Pujani M.p53 and bcl-2 expression in malignant and premalignant lesions of uterine cervix and their correlation with human papilloma virus 16 and 18. South Asian J Cancer,2014,3:48-53.