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铁死亡相关基因的卵巢癌患者生存预测模型 |
李勇, 廖莎 |
410007 长沙,湖南省脑科医院麻醉手术科 |
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摘要 目的 探究铁死亡相关基因在卵巢癌中的预后价值。方法 本研究从公共数据库GEO中下载了卵巢癌患者的mRNA表达谱及相应的临床数据,使用Cox回归模型在GEO人群中构建铁死亡相关多基因预后模型,使用TCGA数据库的卵巢癌患者用于验证,用KEGG和GO功能分析模型中基因设计的免疫通路和功能。结果 大多数与铁死亡相关的基因在GEO队列中的卵巢癌和癌旁正常组织之间有差异表达。构建了一个具有9个基因的预后相关Cox回归模型,将患者分为两个风险组。与低风险组相比,高风险组患者的总生存期显著降低(P<0.001)。模型的1年生存时间的曲线下面积(AUC)为0.842,证实了其有较好的预测能力。KEGG和GO功能分析表明,这9个铁死亡相关基因与免疫相关的途径很多,涉及离子结合、细胞代谢的调控等生物过程以及蛋白聚糖在癌症中、内质网中蛋白质加工、Th17细胞分化、小细胞肺癌、Th1和Th2细胞分化、脂肪细胞因子等途径。结论 这种新型与铁死亡相关基因模型可以用于铁死亡的预后预测,铁死亡靶向治疗可能是卵巢癌潜在治疗方式。
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关键词 :
铁死亡,
卵巢癌,
预后,
模型
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收稿日期: 2021-01-13
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基金资助:湖南省卫计委科研计划课题(20200750;20200598) |
通讯作者:
廖莎(ls13307319521@163.com)
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1 Stewart C,Ralyea C,Lockwood S.Ovarian cancer:An integrated review.Semin Oncol Nurs,2019,35:151-156. 2 Lisio MA,Fu L,Goyeneche A,et al.High-grade serous ovarian cancer:basic sciences,clinical and therapeutic standpoints.Int J Mol Sci,2019,20:952. 3 Xia X,Fan X,Zhao M,et al.The relationship between ferroptosis and tumors:a novel landscape for therapeutic approach.Curr Gene Ther,2019,19:117-124. 4 Stockwell,Brent R.L-5-Ferroptosis:Death by lipid peroxidation.Free Radical Bio Med,2018,120:S7. 5 Hassannia B,Vandenabeele P,Vanden Berghe T.Targeting ferroptosis to iron out cancer.Cancer Cell,2019,35:830-49. 6 Liang C,Zhang X,Yang M,et al.Recent progress in ferroptosis inducers for cancer therapy.Adv Mater,2019,31:e1904197. 7 Homma T,Kobayashi S,Fujii J.Cysteine preservation confers resistance to glutathione-depleted cells against ferroptosis via CDGSH iron sulphur domain-containing proteins (CISDs).Free Radic Res,2020,54:397-407. 8 Wang Y,Zhao G,Condello S,et al.Frizzled-7 Identifies platinum-tolerant ovarian cancer cells susceptible to ferroptosis.Cancer Res,2021,81:384-399. 9 Carbone M,Melino G.Stearoyl CoA desaturase regulates ferroptosis in ovarian cancer offering new therapeutic perspectives.Cancer Res,2019,79:5149-5150. 10 Hassannia B,Vandenabeele P,Vanden Berghe T.Targeting ferroptosis to iron out cancer.Cancer Cell,2019,35:830-49. 11 Zhou B,Liu J,Kang R,et al.Ferroptosis is a type of autophagy-dependent cell death.Semin Cancer Biol,2020,66:89-100. 12 Gryzik M,Asperti M,Denardo A,et al.NCOA4-mediated ferritinophagy promotes ferroptosis induced by erastin,but not by RSL3 in HeLa cells.Biochim Biophys Acta Mol Cell Res,2021,1868:118913. 13 Gagliardi M,Saverio V,Monzani R,et al.Ferroptosis:a new unexpected chance to treat metastatic melanoma?.Cell Cycle,2020,19:2411-2425. 14 Lee J,You JH,Kim MS,et al.Epigenetic reprogramming of epithelial-mesenchymal transition promotes ferroptosis of head and neck cancer.Redox Biol,2020,37:101697. 15 Zhu M,Wang J,Chen C,et al.Transcriptomic analysis of key genes and pathways in human bronchial epithelial cells BEAS-2B exposed to urban particulate matter.Environ Sci Pollut Res Int,2021,28:9598-9609. 16 Dächert J,Ehrenfeld V,Habermann K,et al.Targeting ferroptosis in rhabdomyosarcoma cells.Int J Cancer,2020,146:510-520. 17 Shostak K,Jiang Z,Charloteaux B,et al.The X-linked trichothiodystrophy-causing gene RNF113A links the spliceosome to cell survival upon DNA damage.Nat Commun,2020,11:1270. 18 Liang JY,Wang DS,Lin HC,et al.A Novelferroptosis-related gene signature for overall survival prediction in patients with hepatocellular carcinoma.Int J biol sci,2020,16:2430-2441. |
[1] |
马韦, 王晓雯, 易村犍. 术前外周血SII、NLR及CA125在卵巢癌诊断中的临床价值分析[J]. 中国生育健康杂志, 2023, 34(2): 160-163. |
[2] |
杨君婷, 黄爱群, 陈大方. 基于群组轨迹模型的0~3岁婴幼儿体格发育轨迹特征及影响因素研究[J]. 中国生育健康杂志, 2023, 34(1): 25-34. |
[3] |
唐天一, 魏瑗, 赵扬玉. 双胎妊娠的子痫前期预测研究进展[J]. 中国生育健康杂志, 2023, 34(1): 98-102. |
[4] |
张春莹, 赵薇, 潘晓平, 黄爱群. 6月龄前不同喂养方式对0~12月龄婴儿身长影响的研究[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(6): 518-524. |
[5] |
李春珍, 张丽丽, 袁晓颖, 韩佩桐, 崔洁媛. 儿童不典型膜性肾病临床病理特点及预后[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(6): 559-563. |
[6] |
穆文娟, 郝丽婷, 董勤, 杨建平. 14例甲基丙二酸血症患儿临床表型、基因变异分析及治疗效果评价[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(6): 564-569. |
[7] |
程盈盈, 赵琪, 鲁锦志, 易村犍. 基于生物信息学鉴定与子宫内膜癌免疫微环境相关的预后标记物[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(5): 463-469. |
[8] |
唐代钰, 董晓静. 离体胎盘灌注模型应用的研究进展[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(4): 393-396. |
[9] |
王文湛, 阴克强, 张三元. 基于TCPA数据库分析宫颈癌蛋白表达及其临床意义[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(1): 44-48. |
[10] |
金铭, 刘晓静, 张子怡, 李楠, 叶荣伟. 妊娠期高血压疾病的代谢组学研究进展[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(1): 62-67. |
[11] |
郑明明, 魏超峰, 连方. 空卵泡综合征的最新研究进展[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(1): 74-77. |
[12] |
关慧鑫, 韩世愈. 卵巢癌肿瘤干细胞及其标志物与卵巢癌靶向治疗的研究进展[J]. 中国生育健康杂志, 2022, 33(1): 90-93. |
[13] |
高敏, 王巍, 宋楠, 张乃怿, 郑虹, 高雨农. 术前NLR、PLR和CA125水平对子宫内膜癌预后的评估价值[J]. 中国生育健康杂志, 2021, 32(6): 519-523. |
[14] |
陈林一, 刘菊芬, 丁怡, 纪颖, 张雪娟, 任爱国. 山西省孕期未服用叶酸妇女的叶酸水平、人口特征及行为原因分析[J]. 中国生育健康杂志, 2021, 32(6): 553-556. |
[15] |
胡晓琳, 史欢, 刘晶, 孟玉石, 罗小平, 陈玲. 极早早产儿神经发育预后随访结果及影响因素分析[J]. 中国生育健康杂志, 2021, 32(4): 319-323. |
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